Virus grippaux et paramyxoviridae

Orthomyxoviridae et Paramyxoviridae : Caractéristiques, Maladies et Prévention

Les familles des Orthomyxoviridae et Paramyxoviridae regroupent des virus à ARN simple brin négatif, responsables de diverses maladies respiratoires chez l'homme et l'animal, allant de la grippe à la rougeole, en passant par les infections à virus respiratoire syncytial (VRS) et parainfluenza.

I. Orthomyxoviridae : Les Virus Grippaux

Les Orthomyxoviridae, dont le nom vient du grec "myxo" (mucus) pour leur capacité à se fixer sur les mucoprotéines, sont caractérisés par un génome **ARN simple brin négatif segmenté**. Ce segment du génome est crucial pour leur capacité à subir des variations génétiques.

1. Classification et Structure

• Il existe 7 genres, dont les plus connus sont l'Alphainfluenzavirus (Grippe A), Betainfluenzavirus (Grippe B), Gammainfluenzavirus (Grippe C) et Deltainfluenzavirus (Grippe D).
• Les virions sont sphériques (100-200 nm de diamètre) et possèdent une enveloppe lipidique recouverte de glycoprotéines : l'hémagglutinine (HA) (H1-H18) et la neuraminidase (NA) (N1-N11).
• Les virus Influenza A sont classés selon les variations de HA et NA (ex: H1N1, H5N1). Seuls H1, H2, H3, N1, et N2 infectent sérieusement l'homme.
• Les virus Influenza B sont classés en deux lignées (Yamagata et Victoria).
• L'Influenza C diffère des types A et B et est moins fréquente chez l'homme.

2. Historique et Épidémiologie

• La grippe est connue depuis le XVIe siècle. Le terme "Influenza" vient d'une croyance de la Renaissance attribuant la maladie à une "influence" astrale.
• Des pandémies majeures ont marqué l'histoire :
  • 1918 : Grippe espagnole (A/H1N1)
  • 1957 : Grippe asiatique (A/H2N2)
  • 1968 : Grippe de Hong-Kong (A/H3N2)
  • 2009 : Grippe porcine (A/H1N1pdm09)
• Les virus influenza A proviennent des oiseaux aquatiques et peuvent passer la barrière des espèces.
• La nomenclature des souches virales inclut le type, le lieu et l'année d'isolement, ainsi que les antigènes HA et NA (ex: A/Puerto Rico/8/34 (H1N1)).

3. Variabilité Génétique

La capacité du virus à échapper au système immunitaire repose sur deux mécanismes :

• Dérive antigénique (glissement) : due à des mutations ponctuelles dans les gènes de l'hémagglutinine et de la neuraminidase, entraînant les épidémies saisonnières annuelles.
• Cassure antigénique (glissement) : due à des réassortiments génétiques (échange de segments d'ARN entre deux virus lors d'une co-infection), conduisant à l'apparition de nouveaux sous-types et à des pandémies.

4. Pathogénie et Symptômes

• Le virus cible les cellules épithéliales ciliées de l'arbre respiratoire.
• La période d'incubation est courte (2-3 jours).
• Symptômes généraux : fièvre (38-40°C), frissons, céphalées, myalgies, diarrhée, vomissements.
• Symptômes respiratoires : rhinorrhée, pharyngite, toux, dyspnée.
• Complications : pneumonie virale ou bactérienne, responsables de la mortalité.
• L'infection entraîne la nécrose des cellules ciliées et une forte réponse inflammatoire ("orage cytokinique").

5. Diagnostic et Traitement

• Diagnostic clinique en médecine générale.
• Diagnostic virologique en laboratoire :
  • Examen direct (immunofluorescence des aspirats nasopharyngés).
  • Tests rapides (ELISA).
  • RT-qPCR (biologie moléculaire).
• Prévention de la transmission : masques, distance sociale, désinfection des mains et surfaces, limitation des déplacements.
• Traitement :
  • Symptomatique de la fièvre (ATTENTION : aspirine contre-indiquée chez l'enfant, risque de syndrome de Reye).
  • Spécifique : inhibiteurs de la neuraminidase (Zanamivir, Oseltamivir) dans les 48h suivant les symptômes, réservés aux formes graves ou terrains fragilisés.
  • Antibiotiques uniquement en cas de surinfection bactérienne.
• Vaccination annuelle :
  • Vaccins inactivés trivalents (une souche A/H1N1, une A/H3N2, une B).
  • Vaccins inactivés quadrivalents (incluant les deux lignées B).
  • Vaccins vivants atténués quadrivalents (nasaux, pour les 2-17 ans).
• Priorités de vaccination : femmes enceintes, entourage des nourrissons, nourrissons et sujets à risque, professionnels de santé.

II. Paramyxoviridae

Les Paramyxoviridae sont des virus à ARN simple brin négatif, enveloppés, de 150 à 200 nm de diamètre, avec une nucléocapside à symétrie hélicoïdale. Ils peuvent provoquer la fusion des cellules infectées en syncytia.

1. Classification

Ils se divisent en deux sous-familles :

• Paramyxovirinae : inclut les genres Paramyxovirus (parainfluenza 1, 3), Rubulavirus (parainfluenza 2, 4, oreillons), et Morbillivirus (rougeole).
• Pneumovirinae : inclut les genres Pneumovirus (VRS) et Metapneumovirus.

2. Le Virus de la Rougeole (Morbillivirus)

• Extrêmement contagieux, le terme "rougeole" vient du latin "misella" (misère).
• Période d'incubation : environ 2 semaines.
• Phase prodromique (2-3 jours) : symptômes grippaux, conjonctivite, taches de Koplik (pathognomoniques) sur la muqueuse buccale.
• Éruption : maculopapuleuse, "morbilliforme", apparaît sur le visage et s'étend au tronc et aux membres, accompagnée d'une forte fièvre (jusqu'à 40°C), toux et crépitations pulmonaires.
• Complications rares : encéphalite post-infectieuse, pneumonie à cellules géantes (immunodéprimés), panencéphalite sclérosante subaiguë (très rare, apparition tardive).
• Diagnostic : clinique (éruption typique), sérologie (IgM, IgG), RT-qPCR, immunofluorescence pour antigènes viraux.
• Traitement : Symptomatique. La gammaglobuline anti-rougeoleuse peut être administrée post-exposition aux sujets à risque, ou la vaccination dans les 72h. Supplémentation en vitamine A.
• Prévention : Vaccination ROR (Rougeole-Oreillons-Rubéole) avec des virus atténués. Deux doses sont recommandées (9 et 12 mois, puis avant 6 ans).

3. Le Virus Respiratoire Syncytial (VRS) (Pneumovirus)

• Très contagieux, responsable de fortes épidémies mondiales, surtout chez les nourrissons.
• Transmission : aérosols et contact.
• Période d'incubation : environ 5 jours.
• Symptômes : débute comme un rhume, puis détresse respiratoire et cyanose. Fréquemment, bronchiolite nécrosante et pneumonie interstitielle.
• Risque de décès : important chez les jeunes nourrissons, personnes âgées et immunodéprimées.
• Diagnostic : immunofluorescence indirecte (antigènes viraux dans les lavages nasopharyngés), ELISA, RT-qPCR.
• Traitement : principalement symptomatique. La ribavirine est réservée aux nourrissons avec maladie cardio-pulmonaire préexistante. Les anticorps monoclonaux (Nirsevimab) peuvent être administrés aux nourrissons à haut risque.
• Prévention : Vaccins contre le VRS (AREXVY, Abrysvo) pour les adultes de 60 ans et plus et les femmes enceintes (32-36 semaines), ainsi que l'administration d'anticorps monoclonaux pour les bébés.

4. Les Virus Parainfluenza (Paramyxovirus et Rubulavirus)

• Responsables d'un tiers des infections respiratoires, particulièrement chez les enfants.
• Les types 1 et 2 sont associés à la laryngo-trachéo-bronchite (croup).
• Le type 3 provoque des infections des voies respiratoires inférieures (bronchiolite, pneumonie).
• Pathogénie et réponse immunitaire similaires à celles des infections par le VRS.
• Diagnostic : similaire au VRS, utilisant la RT-qPCR ou l'immunofluorescence indirecte.