Biochimie

Un acide aminé qui entre dans la constitution des protéines. Il existe 20 acides aminés protéinogènes chez l'Homme.

Un acide organique avec un groupement carboxyle (-COOH) et un groupement amine primaire (-NH2) liés au même carbone (carbone alpha), ainsi qu'une chaîne latérale (radical R) spécifique à chaque acide aminé.

Certains rôles sont : Musculaire, Structure (par exemple, collagène), Membrane cellulaire, Signalisation, Système immunitaire (anticorps), Transport dans le sang, Enzymes (catalyse).

C'est le pH du milieu pour lequel la molécule d'acide aminé sera globalement neutre (charge nette égale à zéro). Pour un acide aminé mono-aminé et mono-carboxylique, le pHi est la moyenne des deux pKa qui encadrent la forme neutre.

Ils s'associent par une liaison peptidique, qui est une liaison covalente formée entre la fonction carboxyle de l'un et la fonction amine de l'autre, avec élimination d'une molécule d'eau (réaction de condensation).

1. Structure Primaire : Séquence linéaire unique des acides aminés.
2. Structure Secondaire : Repliements locaux (hélice alpha, feuillet plissé bêta) stabilisés par des liaisons hydrogène.
3. Structure Tertiaire : Forme tridimensionnelle globale de la protéine, résultant de l'assemblage des structures secondaires et des interactions entre les chaînes latérales.
4. Structure Quaternaire : Assemblage de plusieurs chaînes peptidiques (sous-unités) pour former une protéine fonctionnelle.

La dénaturation est la perte de la structure tridimensionnelle (secondaire, tertiaire, et quaternaire si applicable) d'une protéine, entraînant la perte de ses propriétés biologiques. La séquence primaire n'est généralement pas affectée.

Un nucléotide est l'unité monomérique des acides nucléiques (ADN et ARN). Il est composé d'une base azotée (purine ou pyrimidine), un pentose (sucre à 5 carbones : désoxyribose pour l'ADN, ribose pour l'ARN), et d'un ou plusieurs groupes phosphate.

Dans l'ADN, l'Adénine (A) s'apparie avec la Thymine (T) par deux liaisons hydrogène, et la Guanine (G) s'apparie avec la Cytosine (C) par trois liaisons hydrogène.

L'ADN est généralement une double hélice (bicaténaire) contenant du désoxyribose et la base thymine. L'ARN est généralement monocaténaire (simple brin) contenant du ribose et la base uracile à la place de la thymine.

Un acide aminé qui entre dans la constitution des protéines. Il existe 20 acides aminés protéinogènes chez l'Homme.

Un acide organique avec un groupement carboxyle (-COOH) et un groupement amine primaire (-NH2) liés au même carbone (carbone alpha), ainsi qu'une chaîne latérale (radical R) spécifique à chaque acide aminé.

Certains rôles sont : Musculaire, Structure (par exemple, collagène), Membrane cellulaire, Signalisation, Système immunitaire (anticorps), Transport dans le sang, Enzymes (catalyse).

C'est le pH du milieu pour lequel la molécule d'acide aminé sera globalement neutre (charge nette égale à zéro). Pour un acide aminé mono-aminé et mono-carboxylique, le pHi est la moyenne des deux pKa qui encadrent la forme neutre.

Ils s'associent par une liaison peptidique, qui est une liaison covalente formée entre la fonction carboxyle de l'un et la fonction amine de l'autre, avec élimination d'une molécule d'eau (réaction de condensation).

1. Structure Primaire : Séquence linéaire unique des acides aminés.
2. Structure Secondaire : Repliements locaux (hélice alpha, feuillet plissé bêta) stabilisés par des liaisons hydrogène.
3. Structure Tertiaire : Forme tridimensionnelle globale de la protéine, résultant de l'assemblage des structures secondaires et des interactions entre les chaînes latérales.
4. Structure Quaternaire : Assemblage de plusieurs chaînes peptidiques (sous-unités) pour former une protéine fonctionnelle.

La dénaturation est la perte de la structure tridimensionnelle (secondaire, tertiaire, et quaternaire si applicable) d'une protéine, entraînant la perte de ses propriétés biologiques. La séquence primaire n'est généralement pas affectée.

Un nucléotide est l'unité monomérique des acides nucléiques (ADN et ARN). Il est composé d'une base azotée (purine ou pyrimidine), un pentose (sucre à 5 carbones : désoxyribose pour l'ADN, ribose pour l'ARN), et d'un ou plusieurs groupes phosphate.

Dans l'ADN, l'Adénine (A) s'apparie avec la Thymine (T) par deux liaisons hydrogène, et la Guanine (G) s'apparie avec la Cytosine (C) par trois liaisons hydrogène.

L'ADN est généralement une double hélice (bicaténaire) contenant du désoxyribose et la base thymine. L'ARN est généralement monocaténaire (simple brin) contenant du ribose et la base uracile à la place de la thymine.

Glycine (Hydrogène), Alanine (groupement méthyl), Valine, Leucine (groupement isobutyle), Isoleucine (groupement isobutyle).

Un acide aminé qui ne peut pas être synthétisé par l'organisme humain et doit être apporté par l'alimentation.

Le pKa des fonctions carboxyliques est entre 2 et 4 (acides). Le pKa des fonctions amines est entre 9 et 12 (basiques).

Les snRNA sont impliqués dans l'épissage, et les snoRNA dans les modifications chimiques d'autres ARN.

Une molécule chirale possède un carbone asymétrique (4 liaisons différentes), ce qui lui permet d'exister sous forme d'énantiomères (isomères stéréochimiques, L ou D).

Les protéines globulaires sont compactes, sphériques et souvent solubles (ex: hémoglobine, enzymes). Les protéines fibreuses sont de forme filamenteuse et ont un rôle structural (ex: collagène, kératine).

1. Purines : Adénine (A) et Guanine (G).
2. Pyrimidines : Cytosine (C), Thymine (T) et Uracile (U).

La traduction est le processus par lequel l'information génétique contenue dans l'ARNm est utilisée pour synthétiser des protéines, avec l'aide des ribosomes et des ARNt.

Transporter les acides aminés jusqu'au ribosome lors de la synthèse des protéines et reconnaître le codon correspondant sur l'ARNm grâce à son anticodon.

Elle sépare les protéines en fonction de leur taille. Les grosses protéines ne peuvent pas entrer dans les pores de la résine et sont éluées plus rapidement, tandis que les petites protéines pénètrent dans les pores et sont retardées.

Un acide aminé qui n'entre pas dans la constitution des protéines, mais qui peut avoir d'autres rôles biologiques.

1. Chaîne non polaire, hydrophobe, aliphatique. 2. Hydroxyles. 3. Dicarboxyliques et leurs amides. 4. Dibasiques (fonction amine supplémentaire).

Cystéine (contient un groupement thiol) et Méthionine (contient un groupement thioéther).

Le code génétique est l'ensemble des règles qui permettent de traduire la séquence des nucléotides en séquence d'acides aminés. Ses caractéristiques sont : il est universel, non ambigu (un codon code un seul acide aminé), et dégénéré (un acide aminé peut être codé par plusieurs codons).

C'est la séparation des deux brins d'ADN (ou d'ARN double brin) par augmentation de la température, sans rupture des liaisons covalentes. Elle est mesurée par la température de fusion (Tm).

1. ADN (Acide DésoxyriboNucléique) : Support de l'information génétique, transmission et régulation. 2. ARN (Acide RiboNucléique) : Impliqué dans la traduction de l'information génétique en protéines et d'autres rôles fonctionnels.

Un nucléoside est composé d'une base azotée et d'un pentose (sucre à 5 carbones), liés par une liaison N-glycosidique, mais sans groupement phosphate.

Transmettre l'information génétique de l'ADN vers les ribosomes pour la synthèse des protéines.

Dans l'ARN, l'Adénine (A) s'apparie avec l'Uracile (U) et la Guanine (G) s'apparie avec la Cytosine (C).

Exemples : - Phosphorylation : Ajout d'un phosphate sur S, T ou Y. Effet réversible de régulation d'activité. - Glycosylation : Ajout de chaînes d'oses. Rôle dans le repliement, la stabilité, la signalisation. - Ubiquitination : Fixation d'une ou plusieurs ubiquitines. Rôle dans la dégradation des protéines.

La Glycine est le seul acide aminé protéinogène qui n'est pas chiral, car son radical R est un atome d'hydrogène (elle n'a donc pas 4 substituants différents sur son carbone alpha).

Les nucléotides sont liés par des liaisons phosphodiester, formées entre le groupement phosphate d'un nucléotide et le groupement hydroxyle du sucre (pentose) du nucléotide suivant.

L'épissage est un mécanisme de maturation des ARNm chez les Eucaryotes, qui consiste en l'excision des introns (séquences non codantes) et l'assemblage des exons (séquences codantes). Les snRNA (petits ARN nucléaires) sont impliqués.

Une hétéroprotéine est une protéine conjuguée, c'est-à-dire qu'elle est composée d'une partie protéique et d'une partie non protéique appelée groupement prosthétique (ex: hémoglobine avec groupement hème, glycoprotéines avec des glucides).

Les liaisons hydrogène, établies entre les groupements carboxyle et amine du squelette peptidique.