Chapitre 1 : Les Glucides
Les glucides, aussi appelés sucres, sont des molécules organiques essentielles composées principalement de carbone (C), d'hydrogène(H) et d'oxygène (O), suivant souvent la formule brute générale Cm(H2O)m. Parfois, ilspeuvent contenir d'autres éléments comme l'azote (N), le soufre (S) ou le phosphore (P).
Rôles des Glucides
Carburant énergétique : Source d'énergie primaire (glycolyse/cycle de Krebs chez les mammifères).
Stockage d'énergie : Sous forme de glycogène (animaux) ou d'amidon (plantes).
Rôles structurels : Composants de la matrice extracellulaire (MEC) et des parois cellulaires.
Communication cellulaire : Impliqués dans la reconnaissance cellulaire, l'adhésion et la signalisation (glycolipides/glycoprotéines).
Régulation : Influencent la conformation, fonction et interaction de diverses molécules.
Synthèse de macromolécules : Précurseurs de l'ADN et de l'ARN (ribose/désoxyribose).
Des dysfonctionnements du métabolisme des glucides peuvent entraîner des pathologies, comme la galactosémie (déficience enzymatique entraînant une accumulation de galactose),les glycogénoses (maladies musculaires dues à un défaut de stockage ou de dégradation du glycogène) ou l'intolérance au lactose (incapacité à digérer le lactose en glucose et galactose).
Types de Glucides
1. Monosaccharides
Les monosaccharides sont les unités les plus simples des glucides, non hydrolysables en unités plus petites. Ils sont classés en fonction de la nature de leur groupement carbonyle et du nombre d'atomes de carbone.
Classification selon le groupement carbonyle :
Aldoses : Possèdent un groupement aldéhyde (-CHO), généralement en C1.
Cétoses : Possèdent un groupement cétone (>C=O), généralement en C2.
Classification selon le nombre decarbones :
3 C : Trioses
4 C : Tétroses
5 C : Pentoses
6 C : Hexoses
7 C : Heptoses
La numérotation des carbones commence par l'extrémité la plus proche du groupe carbonyle.
Stéréoisomérie des oses :
Les stéréoisomères sont des molécules ayant la même formule chimique mais une organisation spatiale différente. L'orientation des groupes hydroxyle (-OH) dans l'espace est cruciale et peut impacter la fonction de la molécule. La plupart des monosaccharides, à l'exception de la dihydroxyacétone, possèdent un ou plusieurs carbones asymétriques (liés à quatre substituants différents), ce qui leurconfère une stéréoisomérie.
Les stéréoisomères sont distingués en fonction de la position du groupe hydroxyle sur le carbone asymétrique le plus éloigné du groupe carbonyle :
Exemple : L-glycéraldéhyde vs D-glycéraldéhyde.
L'évolution biologique a favorisémajoritairement les oses de la série D.
Le nombre de stéréoisomères possibles pour un monosaccharide est de , où est le nombre de carbones asymétriques. Par exemple, les aldohexoses (6carbones, 4 carbones asymétriques) ont stéréoisomères (8 D et 8 L).
Isomères :
Énantiomères : Stéréoisomères images l'un de l'autre dans un miroir (non superposables). Un énantiomère est dit dextrogyre s'il dévie la lumière polarisée vers la droite, et lévogyre s'il la dévie vers la gauche. Attention, la déviation de la lumière polarisée (dextrogyre/lévogyre) n'est pas directement liée aux désignations L ou D.
Diastéréoisomères : Stéréoisomères qui ne sont pas des images miroir l'un de l'autre.
Épimères : Diastéréoisomères qui diffèrent par la configuration d'un seul carbone asymétrique. Par exemple, le glucose et le galactose sont des épimères du C4.
Aldoses et Cétoses importants :
D-Aldohexoses : D-allose, D-gulose, D-talose, D-allose, D-idose, D-glucose, D-mannose, D-galactose.
D-Aldopentoses : D-ribose, D-arabinose, D-xylose, D-lyxose.
D-Aldotétroses : D-érythrose, D-thréose.
D-Aldotrioses : D-glycéraldéhyde.
Cétoses : D-sédoheptulose (cétoheptose), D-érythrulose (cétotétrose), D-fructose (cétohexose), dihydroxyacétone (cétotriose, le seul ose sans carbone asymétrique).
Structure cyclique des oses :
En solution aqueuse, les aldoses à au moins 4 carbones et les cétoses à au moins 5 carbones existent sous forme cyclique. Cette cyclisation résulte d'une réaction entre le groupement hydroxyle et le carbone carbonyle (hémiacétal pour un aldose, hémicétal pour un cétose).
Cycle furane : Cycle à 5 atomes (4 carbones et 1 oxygène). Exemple : D-fructofuranose. Le D-ribose (un aldose) peut également former un ribofuranose.
Cycle pyrane : Cycle à 6 atomes (5 carbones et 1 oxygène). Exemple : D-glucopyrannose.
Anomères :
La cyclisation d'un ose crée un nouveau carbone asymétrique appelé carbone anomérique. Il existe deux stéréoisomères relatifs à ce carbone : les anomères.
Anomère : Le groupe -OH du carbone anomérique est du côté opposé au groupe -CH2OH (vers le bas en projection de Haworth).
Anomère : Le groupe -OH du carbone anomérique est du même côté que le groupe -CH2OH (vers le haut en projection de Haworth).
Dérivés d'oses :
Les monosaccharides peuvent être modifiés pour former des dérivés ayant des rôles biologiques spécifiques.
Osphates : Ajout d'un groupe phosphate. Exemple : Glucose-6-phosphate (Glc-6-P), qui est une étape clé dans le métabolisme du glucose.
Osamines : Remplacement d'un groupe -OH par un groupe amine (-NH2). Exemples : -D-galactosamine, -D-mannosamine.
N-acétylés : Ajout d'un groupe acétamide à une osamine. Exemple : N-acétyl--D-glucosamine (GlcNac), composant de nombreuxpolysaccharides.
Transformation par Oxydation ou Réduction
Aldoses :
Oxydation : Un aldose peut être oxydé en acide carboxylique.
Oxydation du C1 (groupement aldéhyde): conduit à un acide aldonique (ex: acide gluconique).
Oxydation du dernier carbone (alcool primaire) : conduit à un acide uronique (ex: acide glucuronique).
Oxydation des deux extrémités (C1 et dernier C) : conduit à un acide aldarique.
Réduction : Le groupement aldéhyde est transformé en un groupement alcool (-CH2OH), formant un polyol (ou alditol). Exemple: glucose réduit en sorbitol.
Cétoses :
Applications médicales et biologiques :
Acide glucuronique :
Joue un rôle crucial dans la glucurono-conjugaison, une réaction qui facilite l'élimination des molécules hydrophobes du corps en les rendant plus hydrosolubles.
Exemple : La bilirubine (hydrophobe) est conjuguée à deux molécules d'UDP-glucuronate pour former de la bilirubine conjuguée (hydrophile), qui est ensuite éliminée dans la bile. Un excès de bilirubine non conjuguée peut entraîner une jaunisse.
Vitamine C (acide ascorbique) :
Mesure de la glycémie :
Les oses dont le carbone anomérique est libre (non engagé dans une liaison) sont dits réducteurs.
Le glucose est oxydé par l'enzyme glucose oxydase, produisant du peroxyde d'hydrogène (H2O2). Le H2O2 réagit ensuite avec un substrat chromogène pour produire une couleur, dont l'intensité est proportionnelle à la concentration en glucose.
Cette méthode est utilisée dans les tests colorimétriques de la glycémie, basés sur la loi de Lambert-Beer : , où A est l'absorbance, le coefficient d'extinction molaire, C la concentration et d la longueur du trajet optique.
La concentration est souvent déterminée par une courbe d'étalonnage pour plus de précision.
Les glucomètres utilisent cette méthode enzymatique. Les valeurs normales de glycémie à jeun se situent entre 63 et 110 mg/100 mL (3.5-6.1 mM).
Les glycémies ponctuelles ne suffisent pas toujours pour évaluer le contrôle glycémique à long terme. L'hémoglobine glyquée (HbA1c) est un indicateur de la glycémie moyenne sur plusieurs mois. Le glucose sanguin pénètre les érythrocytes via le transporteur GLUT1 et se fixe de manière non enzymatique à l'hémoglobine, formant l'HbA1c. Des niveaux élevés d'HbA1c sont associés à des complications du diabète (insuffisance rénale, maladies cardiovasculaires, neuropathie, cécité).
2. Oligosaccharides
Les oligosaccharides sont constitués de quelques unités monosaccharidiques (entre 2 et 10) liées ensemble par des liaisons osidiques. Ils peuvent former des chaînes linéaires ou ramifiées.
Liaisons osidiques :
Les monosaccharides sont liés par une liaison covalente résultant de la réaction entre un groupement hydroxyle d'un ose et le carbone anomérique d'un autre ose (ou d'une autre molécule).
Liaison O-osidique : Liaison entre le carbone anomérique d'un ose et un groupe -OH d'un autre ose, avec élimination d'une molécule d'eau.
Liaison N-osidique : Liaison entre le carbone anomérique d'un ose et un groupe amine (-NH2), souvent rencontré dans les nucléosides.
Nomenclature des oligosaccharides :
Tous les monosaccharides, sauf le dernier, prennent le suffixe -osyl.
Le dernier monosaccharide prend le suffixe -ose s'il possède un carbone anomérique libre (réducteur) ou -oside s'il ne possède pas de carbone anomérique libre (non réducteur).
Exemples de disaccharides importants:
Maltose : -D-glucopyranosyl-alpha-D-glucopyranose : disaccharide composé de deux unités de glucose liées par une liaison alpha(1\rightarrow4).Lemaltoseestl′uniteˊreˊpeˊtitivedel′amidonetduglycogeˋne.</p></li><li><p><strong>Lactose:</strong><spandata−latex="β"data−type="inline−math"></span>−D−galactopyranosyl−beta−D−glucopyranose.Disaccharidedulait,composeˊdegalactoseetdeglucose.</p></li><li><p><strong>Saccharose:</strong><spandata−latex="α"data−type="inline−math"></span>−D−glucopyranosyl−beta−D−fructofuranoside.Composeˊdeglucoseetdefructose,c′estlesucredetablecommun,nonreˊducteurcarlesdeuxcarbonesanomeˊriquessontengageˊsdanslaliaisonglycosidique.</p></li><li><p><strong>Treˊhalose:</strong><spandata−latex="α"data−type="inline−math"></span>−D−glucopyranosyl−alpha−D−glucopyranoside.Sucrenonreˊducteur,trouveˊchezlesinsectes.</p></li></ul><p>3.<strong><u>Polysaccharides</u></strong></p><p>Lespolysaccharidessontdespolymeˋresdemonosaccharides,formeˊsde20uniteˊsouplus,etpeuvente^trelineˊairesouramifieˊs.Leurtailleesttreˋsvariable.</p><p>Classificationdespolysaccharides:</p><ulclass="tight"data−tight="true"><li><p><strong>Homopolysaccharides:</strong>Composeˊsd′unseultypedemonosaccharide.</p></li><li><p><strong>Heˊteˊropolysaccharides:</strong>Composeˊsdedeuxaˋquatretypesdemonosaccharidesdiffeˊrents,sereˊpeˊtantsouventenuniteˊsdisaccharidiquesoutrisaccharidiques.</p></li></ul><p>Exemplesd′homopolysaccharides:</p><ulclass="tight"data−tight="true"><li><p><strong>Amidon(veˊgeˊtaux)etGlycogeˋne(animaux):</strong>Polymeˋresdeglucose(maltose)lieˊsprincipalementpardesliaisons<spandata−latex="α(1→4)"data−type="inline−math"></span>pourleschaı^neslineˊaireset<spandata−latex="α(1→6)"data−type="inline−math"></span>pourlesbranchements.Ilsjouentunro^lecentraldanslestockagedel′eˊnergie.Lesliaisons<spandata−latex="α(1→4)"data−type="inline−math"></span>sontcliveˊesparl′<spandata−latex="α"data−type="inline−math"></span>−amylase.</p></li><li><p><strong>Cellulose:</strong>Homopolysaccharidelineˊairedeglucose,lieˊpardesliaisons<spandata−latex="β(1→4)"data−type="inline−math"></span>.L′uniteˊdisaccharidiquedebaseestlecellobiose.Lacelluloseaunestructurefibreuseetestuncomposantmajeurdesparoisdescellulesveˊgeˊtales.Sastructureestrigidifieˊepardenombreuxpontshydrogeˋne.Contrairementauxliaisons<spandata−latex="α"data−type="inline−math"></span>,lesliaisons<spandata−latex="β(1→4)"data−type="inline−math"></span>sontreˊsistantesaˋl′hydrolyseparlesamylaseshumaines,cequirendlacellulosenondigestiblepourl′homme.</p></li></ul><p>Comparaisondesliaisons<spandata−latex="α"data−type="inline−math"></span>et<spandata−latex="β"data−type="inline−math"></span>:</p><ulclass="tight"data−tight="true"><li><p>Lesliaisons<spandata−latex="α"data−type="inline−math"></span>favorisentlescourburesetlesbranchementsdeschaı^nes,augmentantainsilacapaciteˊdestockage(glycogeˋne,amidon).</p></li><li><p>Lesliaisons<spandata−latex="β"data−type="inline−math"></span>favorisentlalineˊariteˊ,conduisantaˋdesstructuresrigidesstabiliseˊespardespontshydrogeˋne(cellulose,chitine).</p></li></ul><p>Exemplesd′heˊteˊropolysaccharides:</p><p>Les<strong>glycosaminoglycanes(GAGs)</strong>sontdesheˊteˊropolysaccharides,principalementlocaliseˊsdanslamatriceextracellulaire(MEC).Ilssontaussiappeleˊsmucopolysaccharidesetsontdespolymeˋreslineˊairesd′uniteˊsdisaccharidiquesreˊpeˊtitives.</p><ulclass="tight"data−tight="true"><li><p>Unedesuniteˊsmonosaccharidiquesestuneosamine(souventN−aceˊtyleˊe).</p></li><li><p>L′autreuniteˊestsouventunacideuroniqueouunmonosaccharidesulfateˊ.</p></li><li><p>Enraisondesgroupescarboxylates(−COO<sup>−</sup>)etsulfates,lesGAGssontfortementchargeˊsneˊgativementaˋpHphysiologique.</p></li></ul><p>ExemplesdeGAGs:</p><olclass="tight"data−tight="true"><li><p><strong>Acidehyaluronique(Hyaluronane):</strong></p><ulclass="tight"data−tight="true"><li><p>Uniteˊdisaccharidiquereˊpeˊteˊe:<spandata−latex="β"data−type="inline−math"></span>−D−glucuronate−(1<spandata−latex="→3)-" data-type="inline-math">\beta\beta(1\rightarrow4).</p></li><li><p>Abondantdansletissuconjonctif,l′humeurvitreˊe,leliquidesynovial.</p></li><li><p>Formeunesolutionvisqueusequiretientbeaucoupd′eau,offrantdesproprieˊteˊslubrifiantes,uneprotectiondesarticulationsetl′eˊlasticiteˊducartilageetdelapeau.</p></li></ul></li><li><p><strong>Chondroı¨tine−4−sulfate:</strong></p><ulclass="tight"data−tight="true"><li><p>Uniteˊdisaccharidique:<spandata−latex="β"data−type="inline−math"></span>−D−acidehyaluronique−(1<spandata−latex="→3)-" data-type="inline-math">\beta\beta(1\rightarrow4).</p></li><li><p>Constituantdescartilages,tendons,ligamentsetvalvescardiaques.</p></li></ul></li><li><p><strong>Heˊparine:</strong></p><ulclass="tight"data−tight="true"><li><p>Uniteˊdisaccharidiquecomplexe,souventun<spandata−latex="α"data−type="inline−math"></span>−L−acideiduroniquesulfateˊ−(1\rightarrow$4)-D-N-acétylglucosamine sulfatée.
Liaisons .
Puissant anticoagulant, utilisé dans le traitement des thromboses.
4. Molécules Glycoconjuguées
Les glycoconjugués sont des molécules biologiquement actives formées d'un ou plusieurs oligosaccharides ou polysaccharides liés à une protéine ou à un lipide.
Types de glycoconjugués :
Protéoglycanes :
Protéines solubles ou transmembranaires auxquelles sont liés un ou plusieurs glycosaminoglycanes (GAGs).
Exemple : L'héparan sulfate est un GAG souvent associé aux protéoglycanes.
Aggregans : Certains protéoglycanes peuvent former des assemblages supramoléculaires gigantesques. Une seule molécule d'hyaluronane sert d'ancrage à un grand nombre de protéines associées à d'autres GAGs (chondroïtine sulfate, kératane sulfate). Ces agrégats peuvent atteindre des tailles de Da et constituent l'échafaudage de la matrice extracellulaire.
Glycoprotéines :
Protéines solubles ou transmembranairesdont un ou plusieurs acides aminés sont liés à un monosaccharide ou un oligosaccharide, ajoutés via une glycosylation enzymatique.
Environ 50% des protéines mammaliennes sont glycosylées. Les protéines plasmatiques sont majoritairement des glycoprotéines (sauf l'albumine).
Présentes dans divers compartiments cellulaires (RE, Golgi, endosomes, lysosomes, vésicules de transport, membrane plasmique, milieu extracellulaire).
Les saccharides liés aux protéines ont des rôles variés : protection, régulation de la conformation, de l'activité, des capacités de liaisonà d'autres molécules.
Deux types de glycosylation des protéines :
O-glycosylation (O-Glycane) : Une liaison O-osidique relie le carbone anomérique d'un monosaccharide à l'hydroxyle (-OH)de la chaîne latérale d'une sérine (Ser) ou d'une thréonine (Thr).
N-glycosylation (N-Glycane) : Une liaison N-osidique relie le carbone anomérique d'un monosaccharide au groupement amide dela chaîne latérale d'une asparagine (Asn). L'Asn doit se trouver dans une séquence signal "NXS" ou "NXT" (Asn-X-Sérine ou Thréonine).
Glycolipides :
Lipides auxquels sont liés des oligosaccharides. Les plus importants sont les cérébrosides, les globosides et les gangliosides, qui sont des sphingolipides et jouent des rôles cruciaux dans les membranes cellulaires, notamment dans lesystème nerveux.
Récapitulatif des types de Glycoconjugués
Les glycoprotéines et les protéoglycanes peuvent être solubles ou attachés à une membrane, soulignant leur diversité fonctionnelle et structurelle dans les systèmes biologiques.