biomoleculaire 1 ueb10

Deux brins antiparallèles enroulés en hélice, avec un squelette sucre-phosphate à l'extérieur et les bases azotées appariées à l'intérieur par liaisons hydrogène ($\text{A}-\text{T}$ : 2 liaisons, $\text{G}-\text{C}$ : 3 liaisons).

Car la polymérisation ne se fait que dans le sens 5' → 3' et les deux brins sont antiparallèles : le brin orienté 3' → 5' est copié en continu (brin avancé), tandis que l'autre est copié de façon discontinue par fragments d'Okazaki (brin retardé).

Chaque brin parental sert de matrice pour la synthèse d'un nouveau brin complémentaire ; chaque molécule fille conserve un brin parental et un brin néo-synthétisé.

Le sucre de l'ARN est un ribose (groupement $\text{OH}$ en $2'$) contre un désoxyribose ($\text{H}$ en $2'$) pour l'ADN, et l'ARN utilise l'uracile ($\text{U}$) à la place de la thymine ($\text{T}$).

Premier niveau de compaction de la chromatine, composé de $146$ pb d'ADN enroulées autour d'un octamère d'histones (deux copies de H2A, H2B, H3 et H4).

Méthode de détermination de l'ordre des nucléotides basée sur l'incorporation de ddNTP (didésoxynucléotides dépourvus de 3'OH) qui bloquent la polymérisation. Les fragments obtenus sont séparés par taille sur gel d'électrophorèse pour lire la séquence.

Mécanisme de déplacement d'un élément génétique dans le génome. La transcription inverse est catalysée par une transcriptase inverse (ADN polymérase ARN dépendante) qui copie un ARN en ADN complémentaire (ADNc).

Technique de réplication ciblée in vitro amplifiant exponentiellement un fragment d'ADN via des cycles de dénaturation ($92$–$94\,°C$), hybridation d'amorces ($55$–$65\,°C$) et élongation ($72\,°C$) par une ADN polymérase thermorésistante.

Synthétiser une courte amorce d'ARN ( primer ) offrant une extrémité 3'OH libre, indispensable à l'ADN polymérase pour débuter la polymérisation.

Néo-synthétisé de façon continue dans le sens $5' \to 3'$, au fur et à mesure que l'ADN parental est séparé.

Courts fragments d'ADN ($100\!-\!200$ nt chez eucaryotes, $1000\!-\!2000$ chez procaryotes) synthétisés de façon discontinue sur le brin retardé.

Séquences répétées en tandem (répétition de $\text{TTAGGG}$) protégeant les extrémités chromosomiques contre les exonucleases, évitant les fusions et contrôlant le vieillissement cellulaire.

Ribonucléoprotéine ajoutant des répétitions d'ADN télomérique aux extrémités $3'$ via une activité de transcription inverse (matrice ARN), permettant de compléter la réplication des télomères.

Les acides nucléiques (chargés négativement) migrent de la cathode vers l'anode dans un gel sous champ électrique ; les plus petits fragments progressent plus vite, permettant une séparation selon la taille.

Ponts faibles, au nombre de 2 entre $A$ et $T$, et de 3 entre $C$ et $G$, stabilisant la double hélice.

L'euchromatine est décondensée, transcrite ; l'hétérochromatine est condensée, majoritairement inactive.

Chez les eucaryotes, la réplication débute à de multiples origines (ARS) et progresse dans les deux sens via deux fourches, jusqu'à leur rencontre.

L'extrémité 5' porte un groupe phosphate libre ; l'extrémité 3' porte un groupe $-OH$ libre. La chaîne est orientée de 5' vers 3'.

Histone de liaison insérée entre l'ADN entrant et sortant du nucléosome ; participe à l'espacement des nucléosomes et à la compaction de la fibre de 30 nm.